本學院創立於78學年，為國內研究水域生物相關科技與學術最為完整的學府，自105學年度起，包括食品科學系、水產養殖學系、生命科學暨生物科技學系、海洋生物科技學士學位學程、海洋生物研究所、食品安全與風險管理研究所、海洋生物科技博士學位學程等3學系2獨立所2學程。 本學院另設有生物技術教學與研究中心、陸生動物實驗中心2個院級研究中心，食品工業研究與服務中心、水生動物實驗中心、水產品產銷履歷驗證暨檢驗中心、電子顯微鏡教學中心4個系級研究中心。 本學院尚有承辦校級單位「漁業推廣委員會」業務，是學校、產業界、漁會與漁業現場聯繫的重要單位。
